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前列腺癌差异基因筛选、功能预测及临床意义分析

         

摘要

目的 筛选前列腺癌的差异表达基因,探讨前列腺癌关键基因的相关分子机制及其临床预后的意义。方法利用美国基因表达综合数据库(American gene expression comprehensive database,GEO)下载三组目标的前列腺癌组织及前列腺组织中mRNA转录组数据。通过癌组织及良性组织的差异表达基因表达谱、GO分析及KEGG通路富集分析,外部验证选定的关键基因与临床预后的关系。结果 差异表达基因生物过程主要在减数分裂和三价铁结合、氧化还原酶等功能富集。筛选出的前6位上调表达的关键基因为PCA3,SIM2,AMACR,HOXC6,ERG和TOP2A。PCA3和TOP2A具有良好的相关性和临床预测意义。结论 PCA3和TOP2A有望成为潜在的前列腺癌肿瘤标志物。

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