猪流行性腹泻病毒变异毒株与传统毒株RT-PCR鉴别诊断方法的建立

赵攀登; 赵胜杰; 王岩; 邓同炜; 卢建洲; 刘静静; 朱文龙; 冀梦瑶; 陈益

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cqvip:为建立猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)变异毒株和传统毒株RT-PCR鉴别诊断方法,本研究根据GenBank中PEDV变异毒株(JN381492.1)和传统毒株(JN599150.1)S基因序列,设计两对特异性引物,进行反应条件优化。结果显示:建立的RT-PCR鉴别诊断方法能够特异性区分PEDV变异毒株和传统毒株,能扩增出变异毒株442 bp的目的片段,而传统毒株是270 bp的目的片段,并且与猪传染性胃肠炎病毒、猪伪狂犬病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪细小病毒、猪呼肠孤病毒、猪瘟病毒、猪脑心肌炎病毒、轮状病毒均无交叉反应;敏感性结果表明该方法能检测出变异毒株和传统毒株的底限均为4×10^4 copies;利用该方法对42份临床腹泻样品进行检测,PEDV阳性率为69%(29/42),变异毒株占总PEDV毒株的93.1%(27/29),传统毒株占总PEDV毒株的6.9%(2/29)。该RT-PCR方法为PEDV的病原鉴别诊断和流行病学调查提供了技术手段。

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来源
《中国动物传染病学报》 |2019年第6期|94-98|共5页
作者
赵攀登; 赵胜杰; 王岩; 邓同炜; 卢建洲; 刘静静; 朱文龙; 冀梦瑶; 陈益;
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作者单位

河南牧业经济学院动物医学院郑州 450046;

河南省动物疫病预防控制中心郑州 450000;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 S852.659.6;
关键词
猪流行性腹泻病毒; S基因; RT-PCR; 鉴别诊断;

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