犬子宫蓄脓组织的转录组学分析

钟华; 宋杉杉; 邵浣婷; 赵瑜; 康劲文; 吴瑶; 苏仁伟

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子宫蓄脓是一种在子宫腔内积聚脓液的常见的犬类疾病,是全世界犬类死亡的主要原因。然而,子宫蓄脓的潜在机制仍知之甚少。本研究旨在探究犬子宫蓄脓的基因组转录组水平变化,筛选差异表达基因、调控通路以及中枢基因,以进一步了解子宫蓄脓的分子机制。本研究通过RNA-Seq比较子宫蓄脓犬与健康犬转录组水平变化收集了蓄脓犬子宫组织,并进行转录组测序分析。分析结果显示共有11812个基因表达存在差异,其中7086个基因在患犬的子宫中上调,而4726个基因下调。GO功能分析显示,差异表达基因主要涉及免疫系统过程、细胞因子活性、趋化因子活性、细胞因子受体结合等生物过程。KEGG-Pathway分析发现,差异表达基因参与炎症与免疫反应激活的信号通路,例如NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、B细胞受体信号通路、吞噬体和自然杀伤细胞介导的细胞毒性,说明炎症和免疫反应激活是犬子宫蓄脓的主要病理阶段。通过使用STRING数据库网络,确定了11个关键中枢基因(如CDK1、ESR 1和SHC 1等),其产物可能作为诊断子宫蓄脓的分子标记出现。综上,本研究展示了犬子宫蓄脓的基因表达的综合概况,有助于更好地了解子宫蓄脓的分子机制。

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来源
《畜牧兽医学报》 |2023年第8期|3383-3392|共10页
作者
钟华; 宋杉杉; 邵浣婷; 赵瑜; 康劲文; 吴瑶; 苏仁伟;
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作者单位

华南农业大学兽医学院;

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正文语种 chi
中图分类 S858.292.724;
关键词
犬; 子宫蓄脓; RNA-SEQ; 炎症; 免疫系统;

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