基于基因组和系谱信息的不同选配方案效果模拟研究

张鹏飞; 何俊; 王立贤; 赵福平

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基于基因组和系谱信息的不同选配方案效果模拟研究

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基因组选配(genomicmating,GM)是利用基因组信息进行优化的选种选配,可以有效控制群体近交水平的同时实现最大化的遗传进展。但基因组选配是对群体中所有个体进行选配,这与实际的育种工作有点相悖。本研究模拟了遗传力为0.5的9000头个体的基础群数据,每个世代根据GEBV选择30头公畜、900头母畜作为种用个体,而后使用基因组选配、同质选配、异质选配、随机交配4种不同的选配方案。其中基因组选配中分别选取遗传进展最大的解、家系间方差最大的解、近交最小的解所对应的交配方案进行选育。每种方案选育5个世代,比较其后代群体的平均GEBV、每世代的遗传进展、近交系数、遗传方差,并重复5次取平均值。结果表明,3种基因组选配方案的ΔG均显著高于随机交配和异质选配(P<0.01),而且,选取遗传进展最大的基因组选配方案的ΔG比同质选配还高出4.3%。3种基因组选配的方案的ΔF比同质选配低22.2%~94.1%,而且选取近交最小的基因组选配方案ΔF比异质选配低11.8%。同质选配的遗传方差迅速降低,在第5世代显著低于除基因组选配中选择遗传进展最大的方案以外的所有方案(P<0.05),3种基因组选配方案的遗传方差比同质选配高10.8%~32.2%。这表明基因组选配不仅可以获得比同质选配更高的遗传进展,同时有效的降低了近交水平,并且减缓了遗传方差降低速度,保证了一定的遗传变异。基因组选配作为一种有效的可持续育种方法,在畜禽育种中开展十分有必要。

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来源
《畜牧兽医学报》 |2022年第10期|3448-3458|共11页
作者
张鹏飞; 何俊; 王立贤; 赵福平;
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作者单位

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室;

湖南农业大学动物科技学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类畜禽遗传、选种、育种;
关键词
模拟数据; 基因组选择; 基因组选配; 遗传进展; 近交;

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