基于生物信息学途径研究阿托伐他汀钙与其他药物的相互作用

裴晶; 齐志刚; 高燕

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目的基于生物信息学途径探讨阿托伐他汀钙与其他药物的相互作用.方法人脐静.脉内皮细胞株EA.hy926分为阿托伐他汀钙(AT)组和二甲基亚砜(DMSO)组,分别加入1×10-5 mol/L阿托伐他汀钙和等体积DMSO培养24h,提取总RNA进行基因表达谱分析,SAM软件分析AT组和DMSO组差异表达倍数在2倍以上的基因.采用基因集富集分析(GSEA)方法对阿托伐他汀钙处理后的内皮细胞基因表达谱进行通路富集分析.使用Connectivity Map (Cmap)筛选与阿托伐他汀钙有相互作用的药物.结果基因芯片表达谱分析共获得AT组与DMSO组比较差异表达2倍以上的基因649个,其中上调基因295个、下调基因354个.使用GSEA进行通路富集分析显示,与DMSO组比较,AT组13条通路中的基因表达上调、113条通路中的基因表达下调.Cmap分析筛选出MS-275、trichostatin A、vorinostat等组蛋白去乙酰化酶抑制剂、白藜芦醇、吩噻嗪类衍生物等药物正性富集分数较高.结论基于生物信息学途径研究药物相互作用切实可行.阿托伐他汀钙与组蛋白去乙酰化酶抑制剂、白藜芦醇及吩噻嗪类衍生物有协同作用.

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来源
《中华生物医学工程杂志》 |2014年第5期|357-361|共5页
作者
裴晶; 齐志刚; 高燕;
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作者单位

济南军区总医院;

济南军区总医院;

山东省德州市第二人民医院;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
生物信息学; 阿托伐他汀钙; 药物相互作用;

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