伴与不伴远处转移乳头状甲状腺癌患者血清的差异蛋白质组学分析及筛选模型的建立

许艳红; 王文静; 宋红俊; 邱忠领; 罗全勇

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目的比较伴远处转移与不伴远处转移的乳头状甲状腺癌（PTC）患者血清的蛋白质组学差异,建立伴远处转移PTC患者的血清蛋白质指纹图谱筛选模型。方法收集36例伴远处转移PTC患者和29例不伴远处转移PTC患者的血清,其中建模组45例（伴远处转移PTC26例,不伴远处转移PTC19例）,盲法筛选组20例（伴远处转移PTC10例,不伴远处转移PTC10例）。采用固定金属亲和表面（IMAC3）芯片,以表面增强激光解析离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术测定得到血清蛋白质谱。运用Ciphergen Proteinchip3.1软件比较伴与不伴远处转移两组PTC患者的血清蛋白质谱的差异。采用生物信息学分析方法建立决策树模型并进行盲法验证。结果在质荷比1.5~20.0ku范围内,两组患者血清中共检测到69个蛋白质峰,其中10个蛋白质峰在两组间差异具有统计学意义（P〈0.05）。用建模组数据构建的决策树模型对20个盲法筛选样本进行归类预测,其灵敏度为80%,特异度为80%。结论伴与不伴远处转移PTC患者的血清蛋白质谱存在显著差异,以此建立的决策树模型对PTC伴与不伴远处转移能够做出较为准确的预测判断。

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来源
《中华临床医师杂志（电子版）》 |2011年第3期|33-36|共4页
作者
许艳红; 王文静; 宋红俊; 邱忠领; 罗全勇;
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作者单位

苏州大学研究生部;

上海交通大学附属第六人民医院核医学科;

上海市疾病预防控制中心公共卫生分子生物学研究室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 R735.34;
关键词
甲状腺肿瘤; 癌; 乳头状; 蛋白质组学; 肿瘤转移; 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术;

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