中国滇西北地区分离流行性乙型脑炎病毒的分子特征研究

孙肖红; 王环宇; 潘晓玲; 付士红; 冯云; 孟维珊; 梁国栋

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中国滇西北地区分离流行性乙型脑炎病毒的分子特征研究

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目的对中国滇西北地区分离的流行性乙型脑炎（乙脑）病毒进行分子特征研究,了解与云南省内其他地区病毒株的差异。方法用RT-PCR的方法扩增滇西北地区分离的13株乙脑病毒PrM、E片段和3′非编码区,对扩增产物进行序列测定。用Clustal 1.8X、DNASTAR、GENEDOC等生物学软件进行核苷酸序列和系统进化分析。结果基于PrM和E基因核苷酸序列的系统进化显示,滇西北分离的13株乙脑病毒中有12株属于基因Ⅰ型,1株为基因Ⅲ型;12株基因Ⅰ型乙脑病毒与云南省其他地区分离的病毒株处于不同分支;和云南省其他地区分离株之间E基因核苷酸序列差异度为0.2%～13.9%;3′非编码区存在两种核苷酸缺失情况,基因Ⅰ型毒株在终止密码子后出现3处缺失,而基因Ⅲ型毒株只有1处缺失。结论滇西北地区乙脑病毒分离株以基因Ⅰ型为主,E基因核苷酸序列与云南省其他地区分离株差异不明显;基因Ⅰ型毒株在3′非编码区存在3处缺失,而基因Ⅲ型毒株则只有1处缺失。

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来源
《中华流行病学杂志》 |2009年第6期||共页
作者
孙肖红; 王环宇; 潘晓玲; 付士红; 冯云; 孟维珊; 梁国栋;
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作者单位

中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;

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正文语种 chi
中图分类传染病;
关键词
流行性乙型脑炎病毒; 分子特征; 基因分型;

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