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广州市2014-2019年H5亚型禽流感病毒流行与基因遗传特征分析

         

摘要

目的分析广州市H5亚型禽流感病毒流行特点及基因进化和变异特征, 为禽流感的防控提供依据。方法对2014-2019年广州市禽类市场外环境标本进行禽流感病毒核酸检测并分析H5亚型流行情况, 随机选取48份(46份来源于环境和2份来源于病例)H5阳性标本进行HA和NA基因测序, 应用生物信息学软件分析分子遗传特征。结果 2014-2019年监测的52 284份环境标本中, 检出H5亚型阳性标本1 094份, 阳性率为2.09%。遗传进化分析显示, HA基因属于Clade 2.3.4.4.C分支, NA基因主要归属于欧亚谱系H6N6进化分支, HA和NA基因的进化以时间聚类为特点, 相近年份流行株聚成一个进化分支。分子特征显示, 48份毒株裂解位点呈现高致病性分子特点, 受体结合位点仍为禽源受体, 但普遍发生S123P、S133A和T156A倾向结合人源受体的位点突变。抗原位点变异主要出现在B、E区, 并表现时间分布的特点, 同一年份流行株常发生与上一年份流行株不同的抗原位点变异。2017年开始所有毒株出现由氨基酸缺失导致的糖基化位点的增加(140-NHT)。结论广州市禽类市场外环境H5亚型禽流感病毒长期流行, 且阳性率占比逐渐升高。测序分析提示, 广州市H5亚型禽流感病毒为Clade 2.3.4.4.C分支H5N6高致病性病毒, 并且持续进化和变异, 特别是普遍出现与人源受体结合能力增强的突变, 需加强监测。

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