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通过常染色体STR基因座进行两两族源推断初探

         

摘要

目的 通过常染色体STR基因座在汉、藏、蒙、维4个民族人群中的等位基因分布特征,对4个民族进行两两族源推断。方法 收集呼伦贝尔蒙古族(500例)、辽宁汉族(300例)、新疆维吾尔族(450例)和西藏藏族(2528例)无关个体生物样本,检验各自17个常染色体STR基因座等位基因并得到基因型,计算每个民族各样本基因型频率。以目前所报道的上述民族样本数最多的各民族等位基因频率为基础,用两种方法进行族源推断:(1)基因型频率商值法:4个民族进行两两比较,将单个样本出现的基因型所对应两民族的基因型频率分别作为分母和分子,分别计算17个基因座基因型频率的商并加和,得到两个商值之和并比较大小,由此判定该样本为两次商值加和中结果较大值所用除法中分子所对应民族;(2)Fisher判别分析法:运用SPSS软件中Fisher判别分析法对各民族17个常染色体基因型频率与民族关系进行分析,探讨该方法对现场生物检材族源推断的可行性。结果 使用基因型频率商值法对4个民族进行两两族源推断计算,藏族与维族判别率最高,达92.00%;藏族与蒙古族次之,为89.67%;再次为蒙古族与维族,为87.00%;汉族与维族判别率达80.00%,汉藏、汉蒙的判别率最低,分别为76.67%和70.67%。判别分析法得到4个民族综合判别率只有47.5%,两两民族判别率也远低于商值法所得结果准确率,与判别分析相比基因型频率商值法更优。结论 根据常染色体STR的等位基因频率,利用基因型频率商值法,在两两民族间进行民族来源的推断或筛查切实可行。

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