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基于二代测序的混合检材精细化分型研究

         

摘要

Objective To genotype mixed samples with next generation sequencing and evaluate its prospects in forensic DNA application. Methods Three mixed biological samples from rapes cases and their reference samples were collected. DNA was extracted using the MagAttract M48 DNA Manual Kit(200). The ForenSeqTMDNA Signature Prep Kit was used for library preparation, and next generation sequencing was performed on the MiSeq FGx system. The ForenSeqTMUniversal Analysis v1.2.1 software was used for data analysis. NGS-based STR results were compared with CE-based genotypes. Results A single length polymorphic STR allele in the mixed profile could be recognized as two sequence polymorphic STR alleles from different donors, which would assist mixed profile analysis. Such phenomenon was observed in D3S1358, D9S1122 and D13S317 in this work. Conclusion Our results suggested that precision STR genotyping of mixed samples based on NGS can provide more information and hints for mixed STR profile separation.%目的 基于二代测序平台进行混合检材精细化STR分型,并评估其法医学应用价值.方法 收集性侵案件中3例混合检材及其比对样本,采用M48磁珠提取纯化试剂盒提取样本DNA,使用ForenSeqTMDNA Signature Prep试剂盒制备文库,MiSeq FGx平台进行测序,ForenSeqTMUniversal Analysis v1.2.1软件进行数据分析,将STR序列多态分型与长度多态分型进行比较.结果 对3例混合检材STR分型进行拆分,在D3S1358、D13S317与D9S1122基因座发现存在同一长度多态等位基因包含两个个体的序列多态等位基因的情况.结论 二代测序技术可对混合检材进行精细鉴别,为混合分型数据拆分提供更多线索和依据.

著录项

  • 来源
    《中国法医学杂志》 |2018年第1期|22-2530|共5页
  • 作者单位

    昆明医科大学法医学院;

    云南 昆明 650500;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    甘肃省临夏回族自治州公安局刑警支队;

    甘肃临夏731100;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    山西医科大学法医学院;

    山西太原030001;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    昆明医科大学法医学院;

    云南 昆明 650500;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    现场物证溯源技术国家工程实验室;

    法医遗传学公安部重点实验室;

    公安部物证鉴定中心;

    北京 100038;

    昆明医科大学法医学院;

    云南 昆明 650500;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 法医物证检验学;
  • 关键词

    法医物证学; 二代测序; 混合检材; 短串联重复序列; 序列多态性;

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