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贵阳地区常见尸食性蝇类mtDNA分子标记的检测

         

摘要

目的 应用mtDNA中COⅠ (348bp)、COⅡ (637bp)及16SrDNA (513bp)基因序列鉴定贵阳地区常见尸食性蝇类的种属.方法 收集贵阳地区常见尸食性蝇类标本,经形态学分类鉴定后提取胸肌DNA,扩增COⅠ (348bp)、COⅡ (637bp)及16SrDNA (513bp)基因片段,测序后用DNAMAN 4.0序列分析软件进行序列拼接,NCBI中的BLAST、MEGA 5.2软件包对所得序列分析建立种内及种间进化分歧率,并构建系统发育树.结果 COⅠ种间平均进化分歧率为12.55%,种间范围在3.0% ~ 18.6%,种内范围在0% ~0.7%;COⅡ种间平均进化分歧率为13.73%,种间范围在5.3% ~21.6%,种内范围在0% ~0.6%;16SrDNA种间平均进化分歧率为4.54%,种间范围在0.4%~7.6%,种内范围在0%~0.4%.结论 COⅠ、COⅡ及16SrDNA可用于尸食性蝇类的种属鉴定,该方法可作为传统分类方法的补充手段.

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