多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶-2与共刺激分子B7-H3相互作用的结构信息学初步探讨

蒋俊华; 邱天宇; 顾文超; 孙海洪; 吴士良; 周迎会

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目的研究多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶-2(ppGalNAc-T2)与共刺激分子B7-H3的相互关系.方法通过同源模拟,得到共刺激分子B7-H3两种不同剪接体(2IgB7-H3,4IgB7-H3)的分子结构,寻找PDB数据库中的ppGalNAc-T2的蛋白质晶体结构,利用软件GRAMM(http://vakser.bioinformatics.ku.edu/main/resources_gramm.php),与同源模拟得到的两种不同剪接体的B7-H3分子结构相结合,寻找两者之间是否存在直接结合的可能.结果成功地模拟了共刺激分子B7-H3两种剪接体的分子结构,发现ppGalNA-T2与共刺激分子B7-H3有相互结合的可能性.结论结构生物信息学的研究发现ppGalNAc-T2分子与B7-H3具有潜在相互作用位点,ppGalNAc-T2可能参与B7-H3蛋白质的O-糖链合成反应,并且很有可能是通过直接接触来催化控制B7-H3分子的O-糖链合成.

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来源
《中国血液流变学杂志》 |2010年第3期|356-359,413|共5页
作者
蒋俊华; 邱天宇; 顾文超; 孙海洪; 吴士良; 周迎会;
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作者单位

苏州大学医学部基础医学与生物科学学院生物化学与分子生物学系,江苏苏州,215123;

苏州大学医学部基础医学与生物科学学院生物化学与分子生物学系,江苏苏州,215123;

苏州大学医学部基础医学与生物科学学院生物化学与分子生物学系,江苏苏州,215123;

苏州大学医学部基础医学与生物科学学院生物化学与分子生物学系,江苏苏州,215123;

苏州大学医学部基础医学与生物科学学院生物化学与分子生物学系,江苏苏州,215123;

苏州大学医学部基础医学与生物科学学院生物化学与分子生物学系,江苏苏州,215123;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类肿瘤学实验研究;
关键词
多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶-2; 共刺激分子B7-H3; GRAMM; 蛋白质同源模拟;

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