大柴胡汤治疗肝细胞癌lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

郑飘; 陈博威; 宁迪敏; 肖唯; 田雪飞

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大柴胡汤治疗肝细胞癌lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

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目的挖掘大柴胡汤治疗肝细胞癌的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,探讨其抗肝癌作用机制.方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GEO、miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库获取大柴胡汤的活性成分、预测靶点及肝细胞癌的差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)、微小RNA(miRNAs)和mRNAs,通过R语言和Perl软件筛选大柴胡汤治疗肝细胞癌的关键lncRNAs、miRNAs、mRNAs.采用Cytoscape3.7.0软件和STRING数据库构建活性成分-靶点网络、lncRNA-miRNA-mRNA转录网络和蛋白相互作用网络,进行GO和KEGG富集分析,并予分子对接验证,进行整合分析.结果得到大柴胡汤治疗肝细胞癌的97个有效成分和42个靶点,构建了由19个关键lncRNAs、23个关键miRNAs和42个关键mRNAs组成的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络.富集分析结果显示,这些靶基因参与了肿瘤的生存、凋亡、自噬、氧化应激、蛋白激酶等生物学过程,主要通过PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和TNF信号通路等发挥作用.结论大柴胡汤治疗肝细胞癌具有多成分、多靶点、多途径协同作用特点,可为相关研究提供依据和方向.

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来源
《中国中医药信息杂志》 |2021年第12期|22-29|共8页
作者
郑飘; 陈博威; 宁迪敏; 肖唯; 田雪飞;
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作者单位

湖南中医药大学中西医结合学院湖南长沙 410208;

湖南中医药大学第一附属医院湖南长沙 410007;

湖南中医药大学中西医结合学院湖南长沙 410208;

中南大学湘雅医院中西医结合研究所湖南长沙 410008;

湖南中医药大学中西医结合学院湖南长沙 410208;

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正文语种 chi
中图分类中药药理学;
关键词
肝细胞癌; 大柴胡汤; 转录网络; 生物信息学; 网络药理学; 分子对接;

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