南极菲尔德斯半岛表层土壤样品中细菌多样性的系统发育分析

李会荣; 孙嘉康; 陈丽珊; 俞勇; 陈波; 任大明

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南极菲尔德斯半岛表层土壤样品中细菌多样性的系统发育分析

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通过PCR结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对从南极长城站附近表层土壤样品中获得16S rDNA序列特征片段V3区序列进行分离.对其中的主要12条DGGE条带进行胶回收,获得的DNA片段经测序以及计算机比对分析发现,它们分别属于β、γ、δ-变形细菌(Proteobacteria)、噬纤维菌-屈挠杆菌-拟杆菌(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides, CFB) 群细菌、放线细菌(Actinobacteria)、蓝细菌属(Cyanobacteria)、酸杆菌属(Acidobacteria)和绿屈挠菌属(Chloroflexi)等系统分类群.南极表层土壤样品中的大部分16S rDNA序列与从其他土壤或沉积物样品中直接获得的序列相似性较高(93%-100%).

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来源
《极地研究》 |2005年第4期|245-254|共10页
作者
李会荣; 孙嘉康; 陈丽珊; 俞勇; 陈波; 任大明;
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作者单位

复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室,上海,200433;

中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室,上海,200136;

复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室,上海,200433;

复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室,上海,200433;

中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室,上海,200136;

中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室,上海,200136;

复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室,上海,200433;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类海洋学;
关键词
南极; 表层土壤; 细菌; DGGE; 16S rDNA;

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