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染色体、阈值——高分辨比较基因组杂交技术的质控关键

     

摘要

目的 讨论高分辨比较基因组杂交(high resolution comparative genomic hybridization,HR-CGH)技术中高分辨染色体玻片的质量以及不同阈值分析方法对HR-CGH 技术的结果影响.方法 以正常男性外周血为材料,制备高分辨染色体玻片,分析滴片方案、后固定、预变性等技术环节对染色体玻片质量的影响,从而确立HR-CGH 的染色体玻片制备及挑选标准.另以10名正常男、女性外周血为材料,进行HR-CGH 检测,杂交结果分别以固定阈值及动态参考阈值(dynamic standard reference intervals,DSRI)进行判定,讨论不同判定方法对HR-CGH 检测结果的影响.结果实验证实,过火、后固定及预变性的实施有利于稳定制备高质量的染色体玻片.另外10名正常人标本的杂交结果,以固定阈值法分析的结果均与核型分析结果一致;以ASI软件附带的DSRI法分析,9例结果与核型一致,1例女性结果出现假阳性,为46,XX,dup(15)(q2.2~2.6).结论 高分辨染色体玻片的背景、染色体分散度、抗变性能力是HR CGH 实验成功的关键.以固定阈值分析结果,不受人群差异限制,可在各实验室间广泛应用.而以DSRI分析结果,则受人群差异限制,该DSRI数据必须来自本地正常人群.

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