猪博卡病毒全基因组序列分析与基因分型研究

覃绍敏; 吴健敏; 马琳; 袁龙; 陈凤莲; 马玲; 白安斌

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猪博卡病毒全基因组序列分析与基因分型研究

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为了解猪博卡病毒(PBoV)的基因组结构和遗传进化规律,并研究可行的PBoV基因分型方法,本研究利用GenBank中登录的28条PBoV全基因组序列信息,采用DNAStar生物信息学软件进行基因组序列分析.结果显示,分别选取全基因组、NS1基因、NP1基因和VP1基因构建的系统进化树,其基因分型结果基本一致,PBoV均被划分为3个基因群,基因群内各病毒株的核苷酸序列同源性较高,并且具有独特的序列特征和规律,而各基因群之间病毒株的核苷酸序列同源性非常低,基因组结构差异较大,充分证明了PBoV基因分型的可行性.

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来源
《中国预防兽医学报》 |2014年第2期|150-153|共4页
作者
覃绍敏; 吴健敏; 马琳; 袁龙; 陈凤莲; 马玲; 白安斌;
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作者单位

广西兽医研究所,广西南宁530001;

广西兽医研究所,广西南宁530001;

广西动物疫病预防控制中心,广西南宁530001;

吉林大学动物科学学院,吉林长春130062;

广西兽医研究所,广西南宁530001;

广西兽医研究所,广西南宁530001;

广西兽医研究所,广西南宁530001;

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正文语种 chi
中图分类家畜病毒学;
关键词
猪博卡病毒; 遗传进化分析; 基因分型;

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