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一株基因Ⅶb亚型新城疫病毒F和HN基因的序列分析

         

摘要

In this study, a Newcastle disease virus (NDV) was isolated from goose in Sanshui district, Foshan, designated Goose/Foshan/2010. The ORF sequences of F and HN gene of the isolate were amplified by RT-PCR and sequenced. The aligning analysis results showed that the isolate was placed into genotype Ⅶb of NDV with a F protein cleavage motif of 112R-RQKR-F117 which was the molecular character of the virulent NDV. Two point mutations of E347D and K495E occurred in neutralizing epitopes of in HN protein. Furthermore, a glycosylation site was deleted in HN protein at aa 538-aa 540. Phylogenetic analysis showed that the Goose/Foshan/2010 was closely related to the early isolates of genotype Ⅶb from Peru and Malaysia. While, it is the first report of genotype Ⅶb NDV isolated from goose in China.%为分析从某鹅病料样品中分离鉴定的一株新城疫病毒(NDV) (Goose/Foshan/2010)F和HN基因的序列特征,本研究采用RT-PCR方法扩增该病毒的F和HN基因的ORF序列,并进行序列测定.经序列比对、进化分析表明,Goose/Foshan/2010株属于基因Ⅶb亚型病毒株,F蛋白裂解位点序列为112RRQKRF117,-HN蛋白由571个氨基酸残基组成,具有强毒株分子特征.对F和HN蛋白分析表明,其HN蛋白存在E347D和K495E两个点突变;此外,HN蛋白缺失了538位~540位的糖基化位点.该分离株为我国首次报道的鹅源基因Ⅶb亚型NDV分离株,与秘鲁及马来西亚早期基因Ⅶb亚型分离株进化关系密切,表明我国目前新城疫的流行情况十分复杂.

著录项

  • 来源
    《中国预防兽医学报》 |2013年第1期|74-76|共3页
  • 作者单位

    广东省农业科学院兽医研究所广东省公共卫生公共实验室禽病研究室,广东广州510640;

    广东省农业科学院兽医研究所广东省公共卫生公共实验室禽病研究室,广东广州510640;

    广东省农业科学院兽医研究所广东省公共卫生公共实验室禽病研究室,广东广州510640;

    广东省农业科学院兽医研究所广东省公共卫生公共实验室禽病研究室,广东广州510640;

    广东省农业科学院兽医研究所广东省公共卫生公共实验室禽病研究室,广东广州510640;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 家畜病毒学;
  • 关键词

    新城疫病毒; 基因Ⅶb亚型; 鹅; F和HN基因;

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