基于ITS-1基因序列的隐孢子虫种群分类

杨建伟; 李国清; 刘霞; 张媛媛; 徐前明

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基于ITS-1基因序列的隐孢子虫种群分类

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本试验以内转录间隔区1(ITS-1)基因作为研究对象,用PCR技术分别对广东(GD)禽源、广东(GD)和安徽(AH)牛源3个隐孢子虫分离株ITS-1基因进行扩增、克隆、序列测定和分析.将扩增序列用DNAStar(4.0)和ClustalX1.81软件与GenBank上登录的参考序列比对,用Phylip3.67构建种群发育进化树,以确定分离株与其他隐孢子虫虫种之间的亲缘关系.通过对ITS-1基因全序列分析,结果表明:禽源隐孢子虫GD分离株为Cryptosporidium baileyi,牛源隐孢子虫GD分离株和AH分离株均为C.andersoni.因此,ITS-1基因可作为隐孢子虫分离株种群分类的遗传标记,从而为隐孢子虫属的种间鉴定以及进一步的分子流行病学调查和分子诊断学研究奠定了基础.

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来源
《中国预防兽医学报》 |2009年第4期|275-278|共4页
作者
杨建伟; 李国清; 刘霞; 张媛媛; 徐前明;
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作者单位

华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642;

华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642;

华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642;

华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642;

华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642;

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正文语种 chi
中图分类 S852.723;
关键词
隐孢子虫; PCR; 内转录间隔区1; 种群分类;

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