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重庆地区流行的PRRSV的ORF5基因变异分析

         

摘要

为了分析重庆地区流行的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的ORF5基因变异情况,我们通过RT-PCR扩增采自重庆地区不同猪场高热病病猪肺组织样本中PRRSV的ORF5全序列,并对其进行生物信息学分析.结果8个病例样本中有5个成功扩增出ORF5全序列.系统进化分析表明它们与国内2006年~2007年间的分离株亲缘关系较近,而与更早的分离株和疫苗MLV株亲缘关系较远.此外,推导氨基酸序列分析表明重庆地区流行的PRRSV与以JXA1株等为代表的同期其它地区分离株比较在ORF5的2个线性抗原表位中均存在独特的变异.本研究结果不仅揭示了重庆地区流行的PRRSV ORF5基因的变异特征,而且提示在PRRSV的防控措施中ORF5基因的变异应受到高度的重视.

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