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鹅源禽副粘病毒NA-1株HN蛋白基因的遗传变异研究

         
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鹅副粘病毒分离株NA-1株经11日龄鸡胚增殖后纯化.提取病毒的基因组RNA,采用RT-PCR扩增出与预期设计的1.7kb大小相符合的特异条带.将扩增产物提纯后克隆入pMD 18-T载体,经纯化、筛选及酶切鉴定后,初步获得了含鹅副粘病毒HN基因的阳性克隆,并对阳性克隆进行了测序.测序后拼接得出HN基因的全序列长度为1 740 bp,该基因的ORF总长为1 716 bp,编码571个氨基酸.与GenBank下载的15株参考毒株比较HN基因编码区全核苷酸序列,发现所测NA-1株与国内标准强毒株F48E9核苷酸的同源性为84.5%,氨基酸的同源性为89.5%;与传统的疫苗株La Sota核苷酸的同源性为82.2%,氨基酸的同源性为88.5%;与鹅源禽副粘病毒SF02株核苷酸的同源性为97.1%,氨基酸的同源性为97.4%;与鹅源禽副粘病毒YG97株核苷酸的同源性为97.3%,氨基酸的同源性97.4%.说明NA-1株和SF02株、YG97株亲缘关系较近,它们三者可能有着共同的来源.根据基因树分析,NA-1株应属于基因Ⅶ型新城疫病毒.由此更进一步证实新城疫可以感染水禽,且对鹅具有高度的致死性.

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