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成都地区猫传性腹膜炎病毒ORF3、7b以及S基因七肽重复区1序列的分析

         

摘要

猫传性腹膜炎(FIP)是由猫冠状病毒引起的猫科常见致死性传染病.为分析成都地区猫传性腹膜炎病毒(FIPV)部分基因的序列特征,本研究从11只FIP患猫的腹水中提取总RNA,采用普通PCR或套式PCR对FIPV的非结构蛋白基因ORF3 (3a、3b和3c)、7b以及S基因七肽重复区1(HR1)序列进行PCR扩增并测序.结果 显示:检测到FIRV的上述几个基因均呈遗传多样性,序列存在很大的个体间差异.3a和3b基因主要表现为氨基酸突变,3c基因在约89%的样品中存在截短.7b基因有7个位点的氨基酸被完全替换.S基因HR1序列融合肽的1045位甲硫氨酸被亮氨酸替换,其下游的1057位丝氨酸被丙氨酸替换.遗传进化树显示,本实验扩增的FIRV 7b及S基因HR1序列与GenBank中国外FIPV相应基因序列亲缘性较高.推测3c基因的截短和/或某些氨基酸的替换的共同作用与病毒的致病性有关.本研究结果为FIP的临床确诊提供了分子诊断依据,增加了临床诊断结果的可靠性.

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