动物病毒宏基因组数据分析平台的建立及应用

史智宾; 王靖飞

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cqvip:病毒宏基因组学(Viral metagenomics)是一门新兴的用于研究环境及宿主中病毒多样性及其生物学特性学科。为了能够更高效、科学地实现宏病毒组数据分析,本研究建立了一个动物病毒宏基因组数据分析平台。该平台的主要功能包括数据质控、数据的预处理、序列拼接和序列注释等,并根据应用需求,建立了两种基因序列注释策略:基于读长序列分析和基于重叠序列分析。应用该分析平台对一个猪源鼻拭子的混合样品中病毒基因组数据进行了分析,结果显示该样品中存在环状病毒、冠状病毒、细小病毒等60多种病毒,证明该平台可满足动物病毒宏基因组数据分析的需求。动物病毒宏基因组数据分析平台的建立为动物病毒流行病学监测及疾病防控提供有效的技术手段。

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来源
《中国预防兽医学报》 |2019年第10期|1041-1046|共6页
作者
史智宾; 王靖飞;
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作者单位

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室黑龙江哈尔滨 150069;

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正文语种 chi
中图分类家畜病毒学;
关键词
动物; 病毒宏基因组; 读长序列分析; 重叠序列分析;

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