地方品种鸡ALV-J的分离鉴定及全基因组序列分析

许默儒; 钱学智; 沈习; 蔡丙严; 穆晓惠; 秦爱建

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地方品种鸡ALV-J的分离鉴定及全基因组序列分析

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cqvip:为研究扬州地方品种苏禽绿壳蛋鸡中禽白血病病毒(ALV)的来源及其变异趋势,本研究从扬州某规模化种鸡场病鸡中分离到多株病毒,并测定了1株ALV-J(JS18YZ09)的全基因组序列,对该全基因组序列进行比对分析,结果显示,分离株全基因组序列与2009年江苏地区蛋鸡分离株JS09GY3同源性最高,为93.7%,但其5’LTR和3’UTR区变异较大。其env基因则与2013年广东肉鸡分离株GD13GZ同源性最高。JS18YZ09株5’LTR序列含有多至6个潜在转录因子结合位点C/EBPalp,同时U3区有11 bp的缺失,在其3’UTR的rTM区存在175 bp的缺失。综合5’LTR,env和3’UTR区序列特征,推测引起本次地方品种苏禽绿壳蛋种鸡禽白血病的ALV-J很可能来源于江苏地区蛋鸡分离株JS09GY3,但其可能已经与广东地区株GD13GZ株发生了重组,且有新的变异趋势。本实验对苏禽绿壳蛋鸡ALV分子流行病学的分析研究丰富了ALV的生物信息数据库。

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来源
《中国预防兽医学报》 |2020年第4期|331-335|共5页
作者
许默儒; 钱学智; 沈习; 蔡丙严; 穆晓惠; 秦爱建;
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作者单位

江苏农牧科技职业学院江苏泰州225300;

扬州大学兽医学院江苏扬州225009;

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正文语种 chi
中图分类家畜免疫学;
关键词
地方品种蛋鸡; 禽白血病; J亚群ALV; 全基因组序列;

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