一株猪流感病毒A/swine/Shanghai/01/2019(H1N1)的分离鉴定及遗传进化分析

程靖华; 陶洁; 李本强; 石迎; 刘惠莉

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为鉴定上海地区猪流感病毒的流行株及其分子生物学特征,本研究从上海地区养殖场采集疑似流感症状的猪咽拭子样品40份,采用套式PCR结合鸡胚分离鉴定方法,从中分离到1株H1N1亚型猪流感病毒(SIV),命名为A/swine/Shanghai/01/2019(H1N1).经全基因组测定和遗传进化分析结果显示该分离株的8个基因节段与欧亚类禽H1N1 SIV同源性最高,其PB2、PB1、PA基因节段可能来源于A/swine/Jiangsu/49/2012 (H1N1)病毒,NA、NP和M基因节段可能来源于A/swine/Shanghai/3/2014 (H 1N1)病毒.该分离病毒的HA蛋白裂解位点为PSIQSR ↓ GLFGAI,为低致病性流感病毒的分子特征.该分离株NA蛋白未出现与神经氨酸酶抑制剂相关的氨基酸突变,M2蛋白S31N突变表明该病毒可能对金刚烷胺类药物具有一定的耐药性.PA蛋白224S和PB2蛋白701N突变提示该分离株对哺乳动物的适应性增强,可能导致其致病性增强,需要加强对此类SIV的监测.结合近年来的监测表明,上海地区猪群中H1N1亚型SIV持续存在,需要持续跟踪监测SIV变异趋势.本研究为防控猪流感提供实验依据.

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来源
《中国预防兽医学报》 |2020年第8期|830-834|共5页
作者
程靖华; 陶洁; 李本强; 石迎; 刘惠莉;
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作者单位

上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海201106;

上海市农业遗传育种重点实验室上海201106;

上海市种猪工程技术中心上海201106;

上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海201106;

上海市农业遗传育种重点实验室上海201106;

上海市种猪工程技术中心上海201106;

上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海201106;

上海市农业遗传育种重点实验室上海201106;

上海市种猪工程技术中心上海201106;

上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海201106;

上海市农业遗传育种重点实验室上海201106;

上海市种猪工程技术中心上海201106;

上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海201106;

上海市农业遗传育种重点实验室上海201106;

上海市种猪工程技术中心上海201106;

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正文语种 chi
中图分类家畜病毒学;
关键词
猪流感病毒; H1N1亚型; 分离鉴定; 遗传进化分析;

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