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牛源乳腺致病性大肠杆菌JL05全基因测序及毒力和耐药基因分析

         

摘要

为研究一株从奶牛乳样中分离到的乳腺致病性大肠杆菌(MPEC)JL05的进化分群情况、耐药表型和耐药基因之间的相关性、毒力因子分布情况,本研究采用PCR法、微量肉汤稀释法和高通量测序法对其进化分群、16种抗菌药物的最小抑菌浓度(MIC)、毒力基因、耐药基因的检测和分析.PCR检测结果表明,MPEC JL05属于B2群.MIC检测结果表明,MPEC JL05除对磺胺异恶唑中介、对呋喃妥因敏感外,对β-内酰胺、头孢菌素、氨基糖苷、抗叶酸、喹诺酮、大环内酯、四环素、苯丙醇类等8类14种抗菌药物均耐药.全基因测序结果表明,MPEC JL05编码基因中存在MPEC特有的fec基因座;VFDB数据库分析表明MPEC JL05具有黏附、侵袭、转运、铁摄取、分泌系统、细菌毒素6类80个毒力基因,并发现了耶尔森菌强毒力岛(HPI);CARD数据库分析表明MPEC JL05菌株具有参与抗生素外排、抗生素失活、抗生素靶点改变、降低对抗生素的渗透性等4类耐药机制的53个耐药基因,且在质粒的耐药基因上下游发现了多个转座酶及整合酶基因.本研究揭示了MPEC JL05复杂的进化史,为更全面的认识MPEC基因组特征、致病力及耐药传播机制提供了参考.

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