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强直性脊柱炎患者外周血环状RNA的表达谱研究

         
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目的筛选AS患者PBMCs中差异表达的环状RNA（circRNA）,分析其表达谱以探讨circRNAs在AS发病中的作用。方法采用circRNA微阵列芯片技术检测3例AS活动期（ASA）患者,3例AS稳定期（ASS）患者和3名健康对照者（HC）PBMCs中circRNAs的表达并通过倍数变化（FC）和P值进行筛选,找到差异表达的circRNAs;从差异表达靠前的circRNAs中随机选择4个circRNAs,采用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）验证芯片结果;对差异表达的circRNAs进行基因本体论（GO）分析,京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析,并通过微RNA（miRNA）靶标预测软件对circRNA/miRNA相互作用关系进行预测。采用t检验和Mann-WhitneyU检验等方法对数据进行统计分析。结果芯片结果显示,ASA组较HC组共有800个显著差异表达的circRNAs（FC＆1.5,P＆0.05）,其中466种上调,334种下调;ASS组较HC组共有1 149个显著差异表达的circRNAs（FC＆1.5,P＆0.05）,其中589种上调,560种下调;ASA组较ASS组间共有233个显著差异表达的circRNAs（FC＆1.5,P＆0.05）,其中145种上调,88种下调。RT-qPCR验证结果提示,4个差异表达的circRNAs表达趋势与芯片结果一致。GO分析结果提示,这些差异表达的circRNAs主要参与无义介导的mRNA衰变、Rho GTPase酶结合等过程;KEGG分析结果在辅助性T细胞（Th）17细胞分化、趋化因子信号通路等处得到富集;miRNA靶标预测软件结果提示差异表达的circRNAs可能靶向结合miR-650、let-7b-5p等miRNAs发挥作用。结论和HC组相比AS患者PBMCs中存在差异表达的circRNAs,推测这些circRNAs可能参与AS的发病。

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