利用ITS1和ITS4通用引物扩增香蕉枯萎病菌核酸片段鉴定其生理小种

曹永军; 程萍; 喻国辉; 黎永坚; 杨紫红; 周林

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利用真菌核糖体rDNA区通用引物ITS1和ITS4,扩增采集自香蕉的13株镰刀菌包括18S rDNA部分序列、ITS1-5.8S-ITS2全部序列和28S rDNA部分序列的片段,通过BLAST序列比对分析,确定13株菌为尖孢镰刀菌[Fusarium oxysporum].采用最大简约法,以层出镰刀菌[F.proliferatum(EU151490)]和茄病镰刀菌[F.solani(GQ376116)]为外群,将13株菌的序列与BLAST检索获得的尖镰孢古巴专化型(F.oxysporum f.sp.Cubense)相应序列构建了系统发育树.系统发育分析结果显示,13株菌与NCBI登录的4个尖镰孢古巴专化型菌株一起被分成3个亚群,亚群聚类结果与回接鉴定结果及文献报道的生理小种结果完全一致.

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来源
《热带作物学报》 |2010年第7期|1098-1102|共5页
作者
曹永军; 程萍; 喻国辉; 黎永坚; 杨紫红; 周林;
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作者单位

华南农业大学资源环境学院,广东广州,510642;

珠海市农业科学研究中心,广东珠海,519075;

珠海市农业科学研究中心,广东珠海,519075;

珠海市农业科学研究中心,广东珠海,519075;

珠海市农业科学研究中心,广东珠海,519075;

珠海市农业科学研究中心,广东珠海,519075;

华中农业大学生命科学技术学院,湖北武汉,430070;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类观赏园艺类病虫害;
关键词
香蕉枯萎病菌; rDNA-ITS; 系统发育分析;

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