低磷胁迫柱花草差异表达基因分析研究

文亦芾; 韩蓉蓉; 单贵莲; 史亮涛; 罗富成; 赵小雪; 曾黎琼

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cqvip:研究柱花草在低磷条件下生长的分子机理和反应机制。采用cDNA-SRAP分子标记技术分离柱花草茎和叶在低磷胁迫下相关基因的差异表达片段,并对其进行生物信息学分析。结果表明,8对引物组合共扩增出差异片段195条,其中抑制型表达片段56条,诱导型表达片段92条,上调表达型差异片段36条,下调表达型片段11条,大小均在50~1000 bp之间。二次扩增后将特异性条带回收后进行测序,通过BLAST比对,共比对出14条差异片段的同源序列,其中8个差异表达的核苷酸序列与已知功能基因(JCVI-FLLj-1K4未知mRNA、NBS-LRR型抗病蛋白、ATP合成酶、醛固酮还原酶、叶绿体RF2)有较高同源性,5个序列与假定基因或预测基因(UPF0051蛋白、蛋白酶启动子、SCEI结合酶、吲哚-3-丙酮酸盐单氧酶)同源性较高。本研究为筛选柱花草响应低磷胁迫的差异基因提供参考。

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来源
《热带作物学报》 |2020年第5期|971-977|共7页
作者
文亦芾; 韩蓉蓉; 单贵莲; 史亮涛; 罗富成; 赵小雪; 曾黎琼;
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作者单位

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

西南大学动物科学技术学院/重庆市高校草食动物工程中心重庆 400715;

云南省农业科学院热区生态农业研究所云南元谋 651300;

云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南昆明 650223;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类多年生豆科牧草;
关键词
柱花草; 磷胁迫; 同源性; cDNA-SRAP; 差异表达;

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