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2017-2018年山东省猪流行性腹泻病毒ORF3基因型分析

         

摘要

为了解山东地区2017-2018年猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,通过RT-PCR方法对山东省各地疑似PEDV病料进行检测,并对阳性样本进行ORF3基因的扩增和遗传进化分析.结果 显示,28份具有代表性的PEDV ORF3序列,大小为675 bp,编码224个氨基酸.遗传进化分析显示,28株PEDV ORF3不存在碱基增加或缺失,出现一定规律的碱基突变.28株ORF3基因同源性为94.2%~ 100%,编码氨基酸同源性为94.7%~99.6%.遗传分析表明,2017-2018年山东省流行的PEDV毒株分为2个亚群,其中22株流行株位于2-1亚群,与韩国病毒株存在一定遗传变异关系,其余6株与南方流行毒株聚类在一起.该试验为持续追踪PEDV的变异趋势和开发PEDV新型疫苗奠定理论基础.

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