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大白猪和长白猪新复等位基因及其多态性与结合肽谱分析

         

摘要

本文分别对5头大白猪和长白猪品系中猪主要组织相容性复合体(SLA-Ⅰ)基因进行了克隆,获得了22条新SLA-Ⅰ等位基因并进行了分析与命名.随后,以SLA-Ⅰ* 1204为代表,表达、组装了pSLA-1*1204复合体;并对其呈递抗原肽谱进行了测定,分析了与猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的匹配肽.结果 显示,SLA-Ⅰ多态性主要发生在其组成抗原结合槽(PBG)的α1和α2结构域,其高变异位点能够直接影响PBG与多肽的亲和力.根据质谱获得的多肽谱分析,pSLA-1*1204的结合多肽的位点为P1、P2、P9位氨基酸.P9位主要为长侧链及芳香烃氨基酸,固定多肽于PBG的C端,P1和P2分别插入PBG的A和B口袋,固定多肽于PBG的N端.通过多肽结合基序分析发现了能与PRRSV匹配的10条潜在细胞毒性T细胞(CTL)候补表位.本试验研究了大白猪和长白猪的SLA-Ⅰ多态性并实际测定了1个新等位基因SLA-1*1204的抗原肽结合谱,为进一步促进猪CTL免疫学发展提供了一定的科学依据.

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