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盖塔病毒分子进化及其迁徙

         
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摘要

目的 了解世界各地分离盖塔病毒分子进化特征及其时空迁徙.方法 用Clustal X1.83、MegaAlign和Gene DOC软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用MEGA 6.0软件绘制系统发生树,采用BEAST v 1.8.1软件包里的Bayesian Stochastic Search Variable Selection(BSSVS)程序进行盖塔病毒的空间动力学分析.结果 盖塔病毒E2基因全长均为1 266 nt,编码422 aa,其核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5％～100％和96.4％～100％.病毒分子进化分析发现,盖塔病毒不存在蚊虫,马匹和猪等宿主动物和媒介的种属和地域分布差异.生物信息学分析结果显示,盖塔病毒起源于马来西亚,此后依次传播至日本、中国、韩国以及蒙古国和俄罗斯等地.结论 自1955年首次分离盖塔病毒至2014年间分离的盖塔病毒E2基因序列较为稳定,未发现病毒基因组之间存在种属及地域分布差异,并且该病毒已经从热带地区传播到欧亚大陆多个国家和地区,因此加强盖塔病毒及人畜动物感染的检测和监测至关重要.%In order to investigate the molecular evolution and spatio-temporal migration of Getah viruses (GETV) isolated around the world,the nucleotide and deduced amino acid sequence of GETVs were analyzed and phylogenetic trees were constructed by using informatics software including ClustalX1.83,MegaAlign,GeneDOC and Mega6.0.The Bayesian Stochastic Search Variable Selection (BSSVS) program in the BEAST v 1.8.1 software package was used to analyze the spatial dynamics of the Getah virus.Results showed that the full-length of Getah virus E2 gene consists of 1 266 nueleotides,encoding 422 amino acids.And the homology of nucleotide and amino acid were 94.5％ 100％ and 96.4％ 100％ respectively.The molecular evolution analysis revealed that there were no species and geographical distribution difference existing among GETV host animals (e.g.horses and pigs) and vectors (e.g.mosquitoes).Bioinformatics analysis showed that GETV originated in Malaysia,then it was spread to Japan,China,South Korea,Mongolia,Russia,etc.GETV E2 gene was relatively stable since GETV was first isolated in 1955.The differences of species and geographical distribution did not exist among GETV host animals and vectors,and the virus has spread from tropical regions to Eurasian continent.Thus,strengthening the detection and monitoring of GETV and its infections in humans and livestock is critical.

著录项

  • 来源
    《中国人兽共患病学报》 |2017年第4期|293-299|共7页
  • 作者

    李元元; 王桂琴; 梁国栋; 刘红; 李晓龙; 付士红; 高晓艳; 雷雯雯; 吕志; 何英; 王环宇;

  • 作者单位

    山西医科大学,太原 030001;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    山西医科大学,太原 030001;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    山东理工大学,淄博 255000;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 100052;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 人体病毒学（致病病毒）;
  • 关键词

    盖塔病毒; 分子进化; 时空迁徙;

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