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长沙市首例人感染H9N2禽流感病毒的HA基因序列特征分析

         

摘要

目的 对长沙市首例人源H9N2禽流感病毒进行病毒分离与HA基因特征序列分析.方法 用细胞培养法在可疑病例标本中分离H9N2禽流感病毒毒株,RT-PCR方法扩增禽流感病毒HA基因全长并测序,对所得结果进行氨基酸同源性与进化树分析.结果 分离的毒株命名为A/Hunan/44558/2015,GenBank登录号为KX595338.毒株存在2处新发突变位点,HAT197D、HAD483N,第313位出现与湖南省人源H9N2毒株A/Lengshuitan/11197/2013相同的糖基化位点NCS.与A/Wild Chicken/Shanghai/C1/2014和A/Envionnment/ Hunan/28028/ 2014的同源性分别为97.9%和97.6%.进化树分析分离的毒株处于Y280分支.结论 发现病毒2处新的基因突变位点,与2014年湖南省环境源毒株同源性较高,存在基因交换重组,从分子水平揭示病毒HA基因的进化趋势.

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