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基于异构网络特征与梯度提升决策树的协同药物预测

         

摘要

cqvip:组合药物在复杂疾病特别是癌症的治疗中发挥越来越重要的作用。以组合药物靶标为初始节点在药物-蛋白质异构网络上执行重启型随机游走,将收敛后的概率分布作为药物组合的特征向量,训练梯度提升决策树模型来预测新的药物组合。在标准药物组合数据集的性能评估表明,该方法比其他七种典型分类器和传统的提升算法具有更好的性能,且基于异构网络的特征显著提升了各分类器的性能,AUC值从0.528提升至0.909。

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