基于图的匹配方法预测蛋白质结构中的二硫键

史晓红; 王燕; 张凯; 罗亮; 许进

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基于图的匹配方法预测蛋白质结构中的二硫键

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摘要

在蛋白质结构预测的研究中,一个重要的问题就是正确预测二硫键的连接,二硫键的准确预测可以减少蛋白质构像的搜索空间,有利于蛋白质的3D结构的预测.论文将一个蛋白质结构中二硫键的预测问题,等价为一个寻找图的最大权的匹配问题.图的顶点表示序列中的半胱氨酸残基,边连接每一顶点,表示一种可能的连接方式,边的权根据一个权值函数赋值,用EJ算法寻找具有最大权的匹配,则这个匹配对应二硫键的正确连接.应用这个方法对蛋白质结构的二硫键进行了预测并取得了良好的结果.

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来源
《计算机工程与应用》 |2007年第13期|30-3275|共4页
作者
史晓红; 王燕; 张凯; 罗亮; 许进;
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作者单位

华中科技大学;

自动控制科学与系统工程系;

武汉;

430074;

华中科技大学;

自动控制科学与系统工程系;

武汉;

430074;

华中科技大学;

自动控制科学与系统工程系;

武汉;

430074;

华中科技大学;

自动控制科学与系统工程系;

武汉;

430074;

华中科技大学;

自动控制科学与系统工程系;

武汉;

430074;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类蛋白质（朊）化学加工工业;
关键词
蛋白质结构预测; 二硫键; 图; 匹配;

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