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计算生物学中的高性能计算(Ⅰ)—分子动力学

         

摘要

分子动力学是高性能计算应用的重要领域,大量的高性能计算资源或机时被用于分子动力学模拟.描述了分子动力学的计算方法和特点,包括常用并行算法、性能改进方式等,介绍了常用的分子动力学大规模并行计算软件及其功能特性,最后展望了分子动力学模拟的发展与挑战.

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