基于多特征融合的增强子-启动子相互作用预测综述

胡宇佳; 甘伟; 朱敏

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基于多特征融合的增强子-启动子相互作用预测综述

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cqvip:研究增强子-启动子相互作用机理有助于人们理解基因调控关系,进而揭示与疾病相关的基因,为疾病诊疗提供新思路和新方法。传统的生物检测方法的实验成本高、耗时长,且受分辨率的限制,难以精确鉴定单个增强子-启动子的相互作用。通过计算方法来解决生物问题已成为近年来的研究热点,此类方法可以通过复杂的网络结构主动学习序列特征和空间结构,进而准确预测增强子-启动子的作用。首先介绍了传统生物实验检测方法的研究现状;然后从序列特征的角度出发,围绕多特征融合的基本思想,对统计学和深度学习方法在增强子-启动子相互作用预测上的应用进行归纳整理;最后对该领域的研究热点和挑战进行总结分析。

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来源
《计算机科学》 |2020年第5期|64-71|共8页
作者
胡宇佳; 甘伟; 朱敏;
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作者单位

四川大学计算机学院成都 610065;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
增强子-启动子相互作用; 多特征融合; 序列特征; 应用综述; 疾病诊疗;

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