棉花光籽基因n_2的精细定位

李思敏; 左东云; 程海亮; 张友平; 王巧连; 刘珂; 冯晓旭; 耿洪伟; 宋国立

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棉花光籽基因n_2的精细定位

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【目的】棉纤维是由胚珠外珠被表皮单细胞经突起并极性伸长而成的,棉花种子上的短绒是由胚珠外珠被表皮单细胞突起而产生的。因此,本研究对棉纤维光籽基因n_2进行定位,旨在为其克隆和功能研究奠定基础。【方法】以海岛棉新海21和陆地棉光籽突变体n_2为亲本构建F_2群体,结合棉花基因组数据,开发简单序列重复标记,定位该基因,获得预测的基因序列,通过实时荧光定量聚合酶链式反应分析候选基因的表达量差异。【结果】光籽基因n_2被定位在染色体A12上,位于标记P61与Z10之间的181 kbp内。该区间共有7个候选基因。实时荧光定量聚合酶链式反应分析显示,候选基因72098在2个亲本中的表达量有显著差异。【结论】本试验精细定位了光籽基因n_2,初步分析了候选基因,为其图位克隆和功能验证奠定了基础。

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来源
《棉花学报》 |2019年第2期|114-120|共7页
作者
李思敏; 左东云; 程海亮; 张友平; 王巧连; 刘珂; 冯晓旭; 耿洪伟; 宋国立;
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作者单位

新疆农业大学;

中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室;

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正文语种 chi
中图分类棉;
关键词
陆地棉; 纤维; 光籽突变体; 精细定位; 表达分析;

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