盐胁迫下陆地棉耐盐品种根系的抑制消减文库构建

叶武威; 赵云雷; 王俊娟; 樊保香

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盐胁迫下陆地棉耐盐品种根系的抑制消减文库构建

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采用抑制消减(SSH)杂交技术构建了陆地棉耐盐品种中棉所35在盐(0.4%NaCl)胁迫后1 d、3 d、5 d和7 d的混合SSH文库.文库质量检测表明,差减杂交效率较高,质量较好.随机挑选200个阳性克隆进行测序,获得160余条高质量的表达序列标签(EST).对序列进行BLAST比对及功能注释,其中有62条unigene 未获得同源性匹配, 42条与未知功能的序列同源性较高;其余56条功能已知的unigene中,与抗逆直接相关的基因有14个,占8.8%,参与新陈代谢及信号转导的基因有11条和10条, 分别占6.9%和6.3%,参与转录调控的基因8条,占5.0%.最后,对这些基因在盐胁迫中的作用进行了注释与讨论.

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来源
《棉花学报》 |2009年第5期|339-345|共7页
作者
叶武威; 赵云雷; 王俊娟; 樊保香;
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作者单位

中国农业科学院棉花研究所,农业部棉花遗传改良重点实验室,河南,安阳,455000;

中国农业科学院棉花研究所,农业部棉花遗传改良重点实验室,河南,安阳,455000;

中国农业科学院棉花研究所,农业部棉花遗传改良重点实验室,河南,安阳,455000;

中国农业科学院棉花研究所,农业部棉花遗传改良重点实验室,河南,安阳,455000;

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正文语种 chi
中图分类 S562.035.3;
关键词
棉花; 抗逆性; 耐盐基因; SSH文库;

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