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水稻条纹病毒安徽分离物CP基因的克隆及序列分析

         

摘要

采集安徽庐江水稻条纹叶枯病感病稻株,提取病叶总RNA。设计特异性引物进行RT-PCR扩增,获得水稻条纹病毒安徽分离物(RSV-AH)的RNA3部分片段,克隆并测序。序列分析表明,该片段全长1 051个核苷酸,其中包含的CP基因全长969个核苷酸,编码322个氨基酸。将RSV安徽分离物CP基因(AH-CP)与其它来源的RSVCP基因进行核甘酸序列相似性比较,结果表明,安徽庐江的RSVCP基因与江苏洪泽的RSVCP基因序列相似性最高,达99.3%。进一步构建RSVCP基因系统关系树,发现安徽庐江的RSVCP基因同样与江苏洪泽的RSVCP基因亲缘关系最近。

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