白菜型油菜和菜薹的InDel标记开发及其RILs群体遗传连锁图谱的构建

孟霖; 刘博; 林良斌; 程峰; 王晓武; 武剑

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通过白菜型油菜‘R-O-18’和菜薹‘L58’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,在全基因组范围内检测到了18479个短插入缺失变异位点(≤5bp)。从中挑选了500个插入/缺失片段为4～5bp的InDel变异位点,将其设计成InDel分子标记并进行试验验证,结果有452个标记通过PCR扩增出单一条带,但仅有106个在‘R-O-18’和‘L58’间表现出多态性,346个没有多态性,48个在PCR中没有扩增。亲本间具有多态性的106个InDel标记可用来检测以‘R-O-18’和‘L58’为亲本构建的RILs基因型,并构建了一张包含99个标记的遗传连锁图谱。

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来源
《园艺学报》 |2012年第8期|1491-1500|共10页
作者
孟霖; 刘博; 林良斌; 程峰; 王晓武; 武剑;
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作者单位

云南农业大学农学与生物技术学院;

昆明650201;

中国农业科学院蔬菜花卉研究所;

北京100081;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类白菜类;
关键词
菜薹; 油菜; 白菜; 插入/缺失; 全基因组重测序; Illumina测序; 遗传连锁图;

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