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1968-2013年我国季节性流感H3N2亚型的进化分析

         

摘要

目的了解我国季节性流感H3N2亚型在1968-2013年间的进化状况,为更好地防范该型流感提供依据。方法从流感基因数据库中(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/Database/)获取在中国发现的季节性流感病毒H3N2亚型的8个基因片段,采用BEAST v1.7.4进行BMCMC时间进化分析,获得Bayesian skyline图。结果季节性流感H3N2亚型在时间进化上其各片段核酸变异率总体在0.26-37.32∕(碱基·年),进化曲线明显地反映出流感在1968-2013年间进化不同。结论季节性流感H3N2亚型的进化在今后一段时间里仍会比较活跃,其中各个片段的进化情况不一致,变化较大的时间拐点值得深入分析。

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