鲤鱼脾脏中保守miRNA的鉴定

陈功义; 赵银丽; 李国喜; 刘变枝; 高春生

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鲤鱼脾脏中保守miRNA的鉴定

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miRNA参与动物免疫系统发育及功能调节,但与鲤鱼免疫相关的miRNA研究还未见报道.为鉴定鲤鱼免疫相关mi RNA,本研究构建了鲤鱼脾脏小RNA文库.通过Solexa测序,共获得纯净序列读数10 603 456条.经过生物信息学分析,鉴定到192种保守miRNA,其中69种为新的鲤鱼mi RNA.表达分析表明,高丰度mi RNA主要集中于let-7、mir-10、mir-15和mir-30等30余个基因家族.mi RNA保守性分析显示,23个家族在原口和后口动物中均存在,46个家族仅在脊椎动物中保守,5个家族仅在鱼类中被鉴定到.此外,GO富集分析表明,鲤鱼脾脏保守mi RNA与免疫系统发育、淋巴细胞活化、免疫应答等相关.本研究首次鉴定了鲤鱼脾脏组织mi RNA转录组谱,增加了鲤鱼已知mi RNA数量,有助于更好地理解鲤鱼免疫防御机制.

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来源
《中国生物化学与分子生物学报》 |2015年第6期|636-644|共9页
作者
陈功义; 赵银丽; 李国喜; 刘变枝; 高春生;
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作者单位

河南农业大学牧医工程学院;

郑州450002;

河南农业职业学院动物科学系;

郑州451450;

河南工业大学生物工程学院;

郑州450001;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类鸡;生物小分子的结构和功能;
关键词
鲤鱼; 脾脏; miRNA; 表达特征;

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