喜树STR候选基因生物信息学及表达分析

张珊; 潘子衿; 高湖川; 黄岚; 陈鹏; 黄乾明; 蒲祥

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异胡豆苷合成酶(STR)是植物萜类吲哚生物碱(TIAs)生物合成的中心酶,它所催化的PS反应生成的异胡豆苷是TIAs的合成前体物.从喜树基因数据库中挖掘筛选到14条注释为STR的候选基因,并通过生物信息学以及RT-qPCR方法,分析其编码蛋白的理化性质、结构特征、系统进化关系以及在喜树无菌幼苗不同时期和不同部位的基因表达情况.序列结构特征分析表明,CaSTR1、CaSTR2、CaSTR3、CaSTR7、CaSTR8、CaSTR11、CaSTR12、CaSTR13和CaSTR14含有5个典型的XXX#§保守区,且在第5个XXX#§区N端邻近区域存有特征的EVXE区.系统进化树分析表明,喜树CaSTR序列多与葡萄和棉花的SSL序列聚为一支,亲缘关系较近.基因相对表达分析结果表明,9条CaSTR候选基因序列在喜树幼苗组织中均有表达,且40 d时CaSTR1、CaSTR2、CaSTR3、CaSTR4、CaSTR7、CaSTR12、CaSTR13候选基因在叶中表达量最高,与喜树碱积累特征一致.本研究表明CaSTR1、CaSTR2、CaSTR3、CaSTR7、CaSTR12、CaSTR13候选基因可能参与喜树碱的生物合成;该结果可为后续喜树STR候选基因的功能研究提供理论依据.

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来源
《应用与环境生物学报》 |2021年第4期|1022-1030|共9页
作者
张珊; 潘子衿; 高湖川; 黄岚; 陈鹏; 黄乾明; 蒲祥;
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作者单位

四川农业大学理学院;

雅安625014;

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正文语种 chi
中图分类其他;
关键词
喜树; 喜树碱; 异胡豆苷合成酶; 生物信息学; 基因表达;

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