焦磷酸测序与PCR产物直接测序在乙型肝炎病毒耐药基因检测中的敏感性比较

孙树梅; 周浩; 周彬

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目的通过与PCR产物直接测序比较,评价焦磷酸测序法在乙型肝炎病毒耐药基因检测中的应用价值。方法选取临床使用拉米夫定抗病毒治疗慢性乙型肝炎患者,分别采用巢式PCR焦磷酸测序法与巢式PCR产物直接测序法检测拉米夫定相关耐药位点rt180变异情况,比较两种方法的敏感性与特异性。结果焦磷酸测序与PCR产物直接测序均能准确的检测出优势病毒株(占总群>90%),焦磷酸测序中rt180M所占比例在90%～50%时,PCR产物直接测序法检出率下降至76.92%及50.00%;焦磷酸测序样本中rt180M所占比例为50%～10%,PCR产物直接测序法对耐药基因的检出率降至15.38%～10.00%;准种(占总群<10%)焦磷酸测序可以测出,但PCR产物直接测序法无法检测出。结论焦磷酸测序的方法监测乙型肝炎病毒变异同PCR产物直接测序法相比,有更好的灵敏性,在抗病毒治疗过程中能够检测HBV准种及种群漂移,对于研究抗病毒疗效及耐药预测具有重要意义。

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来源
《中华医院感染学杂志》 |2012年第14期|2991-2993|共3页
作者
孙树梅; 周浩; 周彬;
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作者单位

南方医科大学南方医院感染管理科;

广东广州510515;

南方医科大学南方医院感染内科;

广东广州510515;

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正文语种 chi
中图分类 R512.62;
关键词
乙型肝炎病毒; 焦磷酸测序; PCR产物直接测序;

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