中国流行的狂犬病病毒时空进化分析

孟胜利; 徐葛林; 雷永良; 吴杰; 严家新; 杨晓明

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中国流行的狂犬病病毒时空进化分析

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本研究对1931~2009年间分离于中国20个省区的167株狂犬病病毒的N基因序列进行进化分析,以探讨中国狂犬病病毒株的基因分型和分组情况、时间和空间的动态进化。结果显示：从中国分离的毒株都属于基因1型狂犬病病毒,可以分为2个进化分支共计8个组,分支Ⅰ包括1~4组,分支Ⅱ包括5~8组;选择压力分析表明中国狂犬病病毒处于较强的净化选择约束下,狂犬病病毒N基因中的核苷酸突变主要是同义突变;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法估计中国狂犬病病毒N基因核苷酸的平均碱基替代率为4×10-4替代/位点/年,共同祖先出现的时间不超过2000年前;迁移分析表明中国狂犬病病毒株存在跨地域传播。

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来源
《病毒学报》 |2011年第3期|231-237|共7页
作者
孟胜利; 徐葛林; 雷永良; 吴杰; 严家新; 杨晓明;
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作者单位

武汉生物制品研究所;

武汉430060;

丽水市疾病预防控制中心;

丽水323000;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类其他病毒;
关键词
狂犬病病毒; 分子流行病; N基因; 地理; 中国; 生物信息学;

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