人类基因组isochore边界的保守性研究

郑文新; 郑卫英; 华琳; 刘红; 李林

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人类基因组isochore边界的保守性研究

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人类基因组由一些较长的,G+C含量相对均匀的DNA片段组成,也就是我们所说的isochore结构。Isochore结构与许多重要的生物学特征相关,如:基因密度、CpG岛等,关于这些已有系统的研究。我们使用基于Z曲线理论的基因组序列分段算法,在单核苷酸精度的水平上定位了人类基因组56个isochore的边界,共得到79个独立的边界。我们发现在这79个边界中,45.6%的isochore边界在与17个脊椎动物基因组比对时,显示出明显的保守性,比如:某段高保守的序列在isochore边界处转换为一段弱保守或者完全不保守序列。另外isochore边界附近的序列组成高度保守。通过和已被实验证实的复制开关点附近的序列相比较。有理由推断这79个isochore边界都有可能是人类基因组中的复制开关位点,这一点有待实验验证。

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来源
《中国优生与遗传杂志》 |2011年第2期|32-33|共3页
作者
郑文新; 郑卫英; 华琳; 刘红; 李林;
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作者单位

首都医科大学生物医学工程学院;

北京100069;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 R341;
关键词
Isochore边界; 人类基因组; 保守性;

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