小鼠正常黑色素细胞与黑色素瘤细胞(B16)mRNA表达差异分析

姬凯元; 范瑞文; 张俊珍; 刘博; 李秀青; 齐淑慧

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黑色素瘤是一种高侵袭性的恶性皮肤肿瘤,转移率高、预后差。研究黑素瘤细胞生物学特性对黑素瘤的治疗和控制具有重要的意义。本研究以C57BL/6J小鼠的正常黑色素细胞及B16黑色素瘤细胞为研究对象,采用二代测序技术分析两种细胞间的转录组表达差异,筛选差异基因,为后续黑色素瘤的形成机制研究提供理论依据。采用差异倍数及错误率分析测序数据,鉴定出1 436个新的mRNA和4 086个差异表达的已知mRNA。GO数据库和KEGG数据库分析显示,差异表达的mRNAs参与了149个调控途径,主要集中在疾病调控、细胞周期调节和环境信息调控方面。qRT-PCR及Western印迹检测发现,调节细胞增殖、迁移的Pdgf-B、Integrinβ1和Integrinβ5以及调节黑色素颗粒增加的Mitf、Tyr、Tyrp1和Tyrp2在B16细胞中的表达量显著高于在正常黑色素细胞中的表达。本研究获得的差异基因为后续黑色素瘤的研究提供了新的候选基因。

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来源
《中国生物化学与分子生物学报》 |2019年第1期|92-100|共9页
作者
姬凯元; 范瑞文; 张俊珍; 刘博; 李秀青; 齐淑慧;
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作者单位

安徽农业大学动物科技学院基础兽医系;

安徽合肥230000;

山西农业大学动物科技学院基础兽医系;

山西太谷030801;

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正文语种 chi
中图分类兽医基础科学;
关键词
黑色素瘤; 黑色素细胞; 差异表达; mRNA;

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