鸭瘟病毒CHv株UL34基因的克隆及分子特性分析

钟小容; 程安春; 汪铭书; 朱德康; 龚永强; 贾仁勇; 罗启慧; 刘菲; 陈孝跃

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鸭瘟病毒CHv株UL34基因的克隆及分子特性分析

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通过生物信息学分析、斑点杂交实验、克隆和测序证实了本实验室构建鸭瘟病毒(Duck plague virus,DPV)CHv株基因文库时新分离的基因(GenBank登录号EF643562)为DPV UL34基因,进一步运用有关分子生物学软件对该基因进行了分子特性分析。结果表明,该基因大小为831bp,编码276个氨基酸的多肽,含有疱疹病毒UL34类似蛋白家族保守区。系统进化树分析显示,其与α疱疹病毒亚科中马立克病毒属的GaHV-2,GaHV-3,MeHV-1,EHV-1和水痘病毒属的CeHV-9,HHV-3的亲缘关系最近,揭示DPV-CHv株应该被划为α疱疹病毒亚科中的单独一类。该编码蛋白在252～274位氨基酸有一个明显的跨膜区,C末端有一微体靶向序列(ARL),但无信号肽;含有4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,3个蛋白激酶C磷酸化位点,5个N-豆蔻酰化位点和1个N-糖基化位点;亚细胞定位主要位于细胞核;密码子偏爱性分析显示其偏爱的密码子第3位碱基多以A和T结尾,属于低表达基因;不同密码子使用频率与酵母、大肠杆菌和人的密码子使用频率比较表明,其与大肠杆菌和酵母较接近,与人差异较大。该分析结果揭示DPV UL34基因为一C端锚定的Ⅱ型膜蛋白基因,体外表达选择大肠杆菌和酵母表达系统较为合适,同时该结果也为进一步开展DPV UL34基因的生物学功能研究具有一定的参考作用。

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来源
《中国兽医学报》 |2010年第2期|196-201|共6页
作者
钟小容; 程安春; 汪铭书; 朱德康; 龚永强; 贾仁勇; 罗启慧; 刘菲; 陈孝跃;
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作者单位

四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心;

四川雅安625014;

动物疫病与人类健康四川省重点实验室;

四川雅安625014;

重庆市合川区环境监测站;

重庆401520;

重庆市合川区动物监督所;

重庆401520;

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正文语种 chi
中图分类家畜病毒学;
关键词
鸭瘟病毒; UL34基因; 分子特性;

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