基于生物信息学数据库分析IER2在肿瘤中高表达及其作用机制

李雪霞; 邹焱堂; 李炫坤; 薛文佳; 彭仲特; 朱慧; 李云; 周飞

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基于生物信息学数据库分析IER2在肿瘤中高表达及其作用机制

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人即刻早期反应基因2(immediate early response 2,IER2)可能参与肿瘤的发生发展,但它在此过程中的作用及表达调控的机制仍不清楚。本研究通过在线数据库GEPIA2与Kaplan-Meier Plotter分析发现:TNF和IER2基因在食管癌组织和宫颈癌组织中高表达。而且IER2基因高表达的食管癌病人的预后显著较差。通过UCSC基因组数据库分析发现,在宫颈癌细胞和淋巴细胞内,TNFα(由TNF基因编码)诱导激活NF-κB结合IER2基因区。qRT-PCR检测证明,在食管癌和宫颈癌等细胞内,TNFα诱导NF-κB在转录水平上调IER2基因的表达。本文据此提出,TNFα诱导NF-κB上调IER2基因的表达可能是其在食管癌和宫颈癌等肿瘤中高表达的调控机制。本研究还通过在线数据库GeneMANIA和String分析发现11个与IER2具有关联性的基因。通过在线数据库Oncomine分析发现了88个基因在食管癌细胞内与IER2基因共表达。其中,包含7个与IER2具有关联性的基因ATF3、DUSP1、EGR1、EGR2、FOSB、JUN、NR4A1。本研究通过Oncomine数据库分析证明,在前列腺癌组织细胞内,这7个基因也与IER2共表达。并通过qRT-PCR检测验证这7个基因在食管癌细胞内与IER2基因共表达。GO注释表明,IER2可能通过与ATF3、EGR1、JUN相互作用,协同参与细胞增殖等生物学过程。CCK8检测证明,IER2基因过表达促进食管癌细胞生长增殖。总之,本研究初步揭示了IER2在食管癌和宫颈癌中高表达的调控机制及其作用,为深入研究该基因功能提供了线索。

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来源
《中国生物化学与分子生物学报》 |2020年第11期|1333-1345|共13页
作者
李雪霞; 邹焱堂; 李炫坤; 薛文佳; 彭仲特; 朱慧; 李云; 周飞;
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作者单位

韩山师范学院食品工程与生物科技学院生物系;

广东潮州521041;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类生物信息论;
关键词
人即刻早期反应基因2; 肿瘤坏死因子α; 核因子κB; 食管癌; 宫颈癌;

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