水稻盐胁迫相关内含子microRNA的表达及其生物发生机制

朱淑华; 王庆伟; 姚民; 张士彦; 唐琳

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水稻盐胁迫相关内含子microRNA的表达及其生物发生机制

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内含子microRNA是一类位于编码基因内含子区域的非编码小RNA。目前,动物内含子microRNA研究报道较多,而关于植物体内含子microRNA的功能及其生物发生机制报道较少。本研究通过高通量测序技术,结合生物信息学方法,发现在盐胁迫条件下水稻幼苗中共85个内含子microRNAs表达,其中差异表达的有24个。预测到的51个靶基因的功能分析,主要涉及抗氧化途径、植物激素信号转导途径及功能基因表达调控途径。此外,根据宿主基因的表达情况推测,共30个内含子microRNAs具有独立表达的功能。通过分析内含子microRNA前体DNA片段上游1 kb序列中的启动子核心元件,初步验证其具有独立表达的能力。因此,推测水稻幼苗在盐胁迫条件下,部分内含子microRNA独立于宿主基因表达,并参与水稻盐胁迫下的自我防御机制。

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来源
《中国生物化学与分子生物学报》 |2017年第3期|294-302|共9页
作者
朱淑华; 王庆伟; 姚民; 张士彦; 唐琳;
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作者单位

四川大学生命科学学院;

成都610064;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类核酸;
关键词
内含子microRNA; 水稻; 高通量测序; 靶基因; 生物发生机制;

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